開展人類表型組研究有一個很重要的目的，就是要發(fā)現(xiàn)基因—表型—環(huán)境之間以及宏觀—微觀表型之間的關(guān)聯(lián)尤其是強關(guān)聯(lián)及其背后的機制。首張“人類表型組導(dǎo)航圖”發(fā)現(xiàn)了150余萬個強關(guān)聯(lián)，也帶來了海量的“問號”，有待科學(xué)家去進一步破解。
膚紋表型是人體外觀表型的重要組成部分。指紋是存在于手指皮膚上的凹凸紋路，因其恒定性及高遺傳性，已成為目前研究最廣泛的膚紋類型。而人類對指紋如何形成、何種基因在其中發(fā)揮了主導(dǎo)作用等生物學(xué)機制仍知之甚少。
為解開以上謎團，中國科學(xué)院上海營養(yǎng)與健康研究所汪思佳研究員團隊、愛丁堡大學(xué)丹尼斯·赫頓教授團隊和復(fù)旦大學(xué)金力院士團隊聯(lián)合國內(nèi)外十余家科研機構(gòu)對此展開深入研究，從定位與指紋紋路表型相關(guān)的遺傳變異入手，面向23000多例個體進行全基因組關(guān)聯(lián)掃描與多群體薈萃分析，從中識別出43個與人類指紋相關(guān)的遺傳基因座。1月7日，相關(guān)研究成果發(fā)表于《細胞》上。
肢體發(fā)育基因影響指紋的“外貌”
研究團隊經(jīng)分析幾百萬遺傳位點和指紋表型之間的關(guān)系后指出，人類肢體發(fā)育相關(guān)基因在指紋表型的形成中發(fā)揮了關(guān)鍵作用。
“我們觀察到，43個與人類指紋表型相關(guān)的遺傳基因顯著富集在肢體發(fā)育與形成的相關(guān)通路，而非皮膚發(fā)育相關(guān)通路。”論文通訊作者汪思佳說，這一特征的發(fā)現(xiàn)令團隊欣喜不已。其中，位于染色體3q26.2區(qū)域臨近EVI1基因的變異位點與中間3枚手指，即食指、中指、無名指指紋的復(fù)合表型顯著相關(guān)，從而為20世紀初就被發(fā)現(xiàn)的“中間三枚手指指紋高度相關(guān)”這一現(xiàn)象提供了表型組學(xué)和遺傳學(xué)解釋。
不止于此，基于小鼠動物模型和人胚胎組織的實驗觀察，研究團隊發(fā)現(xiàn)，人類胎兒從肢體發(fā)育到膚紋形成的系列過程中，支持EVI1基因發(fā)揮塑造四肢和手指作用的，正是表達于肢體發(fā)育期的間充質(zhì)細胞，而非皮膚發(fā)育期的上皮細胞。這進一步與研究結(jié)論相印合：指紋相關(guān)基因通過調(diào)控肢體發(fā)育來影響指紋的“樣貌”。
通過多表型關(guān)聯(lián)分析，該研究也發(fā)現(xiàn)指紋“樣貌”與手指長度比例間的緊密相關(guān)性，兩者有相同遺傳基礎(chǔ)。如小指相對越長，掌長相對越短，雙手斗形花紋越多;而食指遠端指節(jié)相對越長，斗形花紋則越少。
“通過這項研究，我們揭示了影響指紋‘外貌’形成的是一系列肢體發(fā)育相關(guān)的重要基因，這些基因在人體發(fā)育中往往起著重要的‘一因多效’作用。”汪思佳說，肢體發(fā)育基因是指紋表型的內(nèi)在影響因素。
繪出全球首張“人類表型組導(dǎo)航圖”
順著這一思路，該項研究為膚紋與人體其他表型與疾病的關(guān)聯(lián)研究提供了重要理論基礎(chǔ)，有望打通宏觀與微觀表型的聯(lián)系與作用機制。“目前，科學(xué)界已經(jīng)發(fā)現(xiàn)不同的膚紋表型與許多先天遺傳性疾病之間的關(guān)聯(lián)，比如唐氏綜合征患者可能會有斷掌、足拇趾弓狀球紋等特征。”汪思佳說，他們團隊正和復(fù)旦大學(xué)附屬兒科醫(yī)院等醫(yī)療機構(gòu)合作，希望將相關(guān)研究成果盡早運用在新生兒先天性疾病的早期篩查中，實現(xiàn)早診斷、早治療。
開展人類表型組研究有一個很重要的目的，就是要發(fā)現(xiàn)基因—表型—環(huán)境之間以及宏觀—微觀表型之間的關(guān)聯(lián)尤其是強關(guān)聯(lián)及其背后的機制。據(jù)悉，中外科學(xué)家正合作推進人類表型組大科學(xué)計劃。正在張江平臺開展的上海自然人群健康表型核心隊列研究，將對相當規(guī)模的志愿者群體盡可能多、盡可能全地采集表型數(shù)據(jù)，進而發(fā)現(xiàn)并解析表型之間的強關(guān)聯(lián)，尤其是那些與人類健康息息相關(guān)的表型間的強關(guān)聯(lián)，最終形成一張由各種強關(guān)聯(lián)組成的“導(dǎo)航圖”，為未來的生命健康研究提供新的指引和方向。
目前，通過對800余人、每人測量近3萬個表型的隊列研究，聯(lián)合團隊已經(jīng)初步繪制了全球首張“人類表型組導(dǎo)航圖”，發(fā)現(xiàn)了150余萬個強關(guān)聯(lián)，其中跨尺度強關(guān)聯(lián)占39%，大部分是科學(xué)界首次發(fā)現(xiàn)。“這張‘導(dǎo)航圖’，為我們帶來了海量的‘問號’，正等待科學(xué)家去進一步研究、破解，這也是我們下一步的重要工作之一。”論文共同通訊作者、中國科學(xué)院院士、復(fù)旦大學(xué)教授金力說道。(岑 盼 本報記者 王春)
